Ở mùa bóng 2020, Công Phượng và các đồng đội sẽ chinh chiến ở 4 đấu trường lớn là V.League, cúp Quốc Gia, AFC Cup và ASEAN Club Championship. Tuy nhiên do ảnh hưởng của dịch Covid-19, giải đấu được mệnh danh là Champions League Đông Nam Á (ACC) đã phải dời lịch tổ chức sang năm 2021.
Theo lịch ban đầu, TP. HCM sẽ tập luyện trở lại vào ngày 20/3. Tuy nhiên việc V.League bị kéo dài thời gian tạm hoãn cũng như AFC Cup dời lịch thi đấu, Công Phượng và các đồng đội được nghỉ thêm 4 ngày.
Khi Chính phủ ra thông báo khẩn về việc tránh tụ tập đông người để ngăn ngừa dịch Covid-19 lây lan, CLB quyết định cho các cầu thủ nghỉ thêm ít nhất đến hết 30/3.
Với diễn biến hiện tại của dịch Covid-19, có thể thời gian nghỉ của TP. HCM sẽ còn tiếp tục kéo dài. Chưa thể tập trung tập luyện trở lại, phong độ của đội bóng sẽ bị ảnh hưởng rất nhiều, nhất là khi thầy trò HLV Chung Hae-seong đặt mục tiêu cao ở cả 3 đấu trường tham dự.
Từ đầu mùa giải đến nay, TP. HCM là đội bóng Việt Nam có số trận đấu chính thức nhiều nhất: 1 trận AFC Champions League, 3 trận AFC Cup, 1 trận siêu cúp Quốc Gia, 2 trận V.League.
Ở giai đoạn chuẩn bị cho mùa giải mới, TP. HCM đã gặp phải những chấn thương đáng tiếc của Thanh Bình, Văn Thuận,... cách đây không lâu là trường hợp của Trần Phi Sơn ở AFC Cup. Khi mùa giải bước vào giai đoạn khốc liệt nhất, vấn đề về thể lực, điểm rơi phong độ sẽ là thách thức cực lớn cho TP. HCM.
Tuy nhiên, ở thời điểm trước mắt an toàn sức khỏe của các cầu thủ mới là điều quan trọng nhất. HLV Chung Hae Seong khẳng định dịch chưa hết thì không nên bàn tới bóng đá.
Chủ tịch Nguyễn Hữu Thắng cũng đưa ra quan điểm tương tự. TP. HCM đang có phong độ tốt và dẫn đầu bảng xếp hạng cả ở AFC Cup lẫn V.League 2020.
Dàn sao ĐTQG lực bất tòng tâm, 'dải ngân hà' V-League lại thua thảm Hà Nội FC 
